Иммунология №2 2011

В. И. Коненков, В. Ф. Прокофьев, А. В. Шевченко, О. В. Голованова

Лаборатория клинической иммуногенетики Учреждения Российской академии медицинских наук. Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения PAMH (630117, Новосибирск, ул. Академика Тимакова, д. 2)

Шевченко Алла Владимировна — канд. биол. наук, ст. науч. сотр., тел. 8(383)227-01-94, факс 8(383)227-01-96, e-mail: shalla64@mail.ru.

ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ КАК ОДИН ИЗ ФАКТОРОВ ДЕМОГРАФИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ЕВРОПЕОИДНОГО НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ

Представлен результат полилокусного анализа частот распределения генотипов в 9 точках полиморфизма 5 генов цитокинов в различных по полу и возрасту группах 531 представителя европеоидного населения Сибири. Исследовался полиморфизм генов TNFA: С-863A, G-308A и G-238A; IL1β T-511С и T-31C; IL4 C-590T; IL6 G-174C, IL1O A-1082G и C-592A. Показано, что их частота достоверно различается среди мужчин и женщин, лиц младшего и старшего возраста. Из 262 143 теоретически возможных комбинаций, в анализируемой выборке реально выявлено 19 923, что свидетельствует о неслучайном характере комбинаций аллельных вариантов анализируемых генов. Целый ряд комбинаций генотипов цитокинов полностью отсутствуют среди женщин, или их частота составляет доли процента. Специфичность выявления таких комбинаций для мужчин 100%, что приближает их к достоверным генетическим гендерным маркерам. Установлено полное отсутствие встречаемости 10 комбинаций в старшей возрастной группе, что может свидетельствовать о выбывании с возрастом по разным причинам обладателей таких комбинаций из старших возрастных групп, а само их наличие является неблагоприятным прогностическим признаком для продолжительности жизни индивида.

Ключевые слова:  полиморфизм генов цитокинов, половые и возрастные различия

ЛИТЕРАТУРА

1. Алексеев Л. П., Хаитов P. M. Клиническая иммуногенетика // Цитокины и воспаление. — 2005. — Т. 4, № 3. — С. 37—39.

2. Вейр Б. Анализ генетических данных: Дискретные генетические признаки: Пер. с англ. — М., Мир, 1995.

3. Генофонд населения Сибири / Под ред. В. И. Коненкова и др. — Новосибирск, 2003.

4. Гланц С. Медико-биологическая статистика: Пер. с англ. — М., 1998.

5. Голованова О. В., Коненков В. И., Шевченко А. В. и др. Полиморфизм гена TNF (C-308A, G-863A, G-238A) у больных раком молочной железы // Иммyнoлoгия. — 2009. — № 2. — С. 92—95.

6. Голованова О. В., Коненков В. И., Шевченко А. В., Смольникова М. В. Частоты аллелей генов DQA1, DQB1 и TNFA у пришлого населения Западной Сибири // Генетика. — 2009. — Т. 45, № 8.- С. 1118-1124.

7. Зонова Е. В., Голованова О. В., ЛеоноваЮ. Б. и др. Зависимость эффективности терапии от уровня сывороточных цитокинов у больных ревматоидным артритом // Бюл. СО РАМН. — 2008. — № 5. — С. 72—78.

8. Коненков В. И. Медицинская и экологическая иммуногенетика. — Новосибирск, 1999.

9. Коненков В. И., Карпова А. В., Свечникова Н. Н. и др. Ассоциированность аллелей гена фактора некроза опухоли (G-308A) с HLA-антигенами локусов DRB1, DQA1, DQB1 у больных атопическим дерматитом // Иммунология. — 2007. — № 6. — С. 331—335.

10. Коненков В. И., Голованова О. В., Дортман В. В. и др. Полиморфизм гена TNFA и неравновесное сцепление TNFA и HLA-генов II класса (DRB1, DQA1 и DQB1) в популяции сибирских европеоидов // Иммунология. — 2008. — № 1. — С. 6—10.

11. Радченко Л. П. Основные показатели здоровья населения и здравоохранения Сибирского федерального округа в 2008 году // Информационный сборник статей и аналитических материалов. — Новосибирск, 2009. — Вып. 8.

12. Реброва О. Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ Statistica. — М., 2002.

13. Шевченко А. В., Голованова О. В., Коломейчук М. Ю. и др. Полиморфизм промоторного региона генов IL-4, IL-6 И IL-10 у пациенток с раком молочной железы / Мед. иммунол. — 2009. — Т. 11, № 1. — С. 21—28.

14. Шевченко А. В., Голованова О. В., Коненков В. И. и др. Анализ взаимосвязи полиморфизма гена (-174 G/C) и классических факторов риска у пациентов с острым инфарктом миокарда в анамнезе // Мед. иммунол. — 2009. — T. 11, № 6. — С. 557—566.

15. Шевченко А. В., Голованова О. В., Коненков В. И. и др. Анализ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ-2 и –9 у пациентов с ишемической болезнью сердца // Тер. арх. — 2010. — Т. 82, № 1. — С. 31—34.

16. Юнкеров В. И., Григорьев С. Г. Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований. — СПб., 2002.

17. Ackerman H., Usen S., Mott R. Haplotypic analysis of the TNF locus by association efficiency and entropy //Genome Biol. — 2003. — Vol. 4. — P. 24.

18. Asghar Т., Yoshida S., Kennedy S. et al. The tumor necrosis factor-a promoter-1031C polymorphism is associated with decreased risk of endometriosis in a Japanese population // Hum. Reprod. — 2004. — Vol. 19, N 11. — P. 2509—2514.

19. Choi E., Lee H. J., Yoo T., Chanock S. A. Common haplotype of interieukin-4 gene IL4 is associated with severe respiratory syncytial virus disease in Korean children // J. Infect. Dis. — 2002. — Vol. 186. — P. 1207—1211.

20. Hollegaard M. V., Bidwell J. L. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases. Supplement 3 // Genes and Immun. — 2006. — Vol. 7. — P. 269—276.

21. Kube D., Platzer C., von Knethen A. et al. Isolation of the human interleukin 10 promoter. Characterization of the promoter activity in Burkitt’s lymphoma cell lines // Cytokine. — 1995. — Vol. 7. — P. 1—7.

22. Middleton D., Menchaca L., Rood H., Komerofsky R. New allele frequency database: http://www.allelefrequencies.net. // Tissue Antigens. — 2003. — Vol. 61. — P. 403—407.

23. Mock C. C., Lanchbury J. S., Chan D. W., Lau C. S. Interleukin-10 promoter polymorphisms in Southern Chinese patients with systemic lupus erythematosus // Arthr. and Rheum. — 1998. — Vol. 41. — P. 1090—1095.

24. Padyukov L., Hahn-Zoric M., Lau Y. L., Hanson L. A. Different allelic frequencies of several cytokine genes in Hong Kong Chinese and Swedish Caucasians // Genes and Immun. — 2001. — Vol. 2. — P. 280—283.

25. Perrey C., Pravica V., Sinnott P. J., Hutchinson I. V. Genotyping for polymorphisms in interferon-gamma, interleukin-10, transforming growth factor-beta 1 and tumour necrosis factor-alpha genes: a technical report // Transplant. Immunol. — 1998. — Vol. 6. — P. 193—197.

26. Pollanen P. J., Karhunen P. J., Mikkelsson J. et al. Coronary artery complicated lesion area is related to functional polymorphism of matrix metalloproteinase 9 gene an autopsy study // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. — 2001. — Vol.21. — P. 1446—1450.

27. Rosenwasser L. J., Klemm D. J., Dresback J. K. Promoter polymorphisms in the chromosome 5 gene cluster in asthma and atopy // Clin. Exp. Allergy. — 1995. — Vol. 25, Suppl. 2. — P. 74—78.

28. Sansbury L. B., Bergen A. W., Wanke K. T. et al. Inflammatory cytokine gene polymorphisms, nonsteroidal anti-inflammatory drug use, and risk of adenoma polyp recurrence in the polyp prevention trial // Cancer Epidemiol. Biomarkers Prevent. — 2006. — Vol. 15. — P. 494—501.

29. Waterer G. W., Wunderink R. G. Science review: Genetic variability in the systemic inflammatory response // Crit. Care. — 2003. — Vol. 7, N 4. — P. 308—314.

30. Zhang D., Zheng H., Zhou Y. et al. Association of IL-1beta gene polymorphism with cachexia from locally advanced gastric cancer // BMC Cancer. — 2007. — Vol. 7. — P. 45—51.