Молекулярная генетика, микробиология и вирусология №4 2007

Дмитриев А. В., Шен А. Д., Тотолян А. А.

Прямые повторы и спейсеры гена sak0192 Streptococcus agalactiae — генетические маркеры для характеристики штаммов

В настоящем исследовании предложен новый метод дифференцировки штаммов Streptococcus agalactiae, основанный на обнаружении полиморфизма гена гипотетического белка sak0192, который у различных штаммов Str. agalactiae содержит варьирующее количество правильно чередующихся прямых повторов и спейсерных областей размером соответственно 16 и 44 п. н. Последовательности прямых повторов в основном идентичны, тогда как спейсеры характеризуются выраженной гетерогенностью. В целом структурная организация гена sak0192 аналогична организации областей с прямыми повторами и спейсерами в геномах Mycobacterium tuberculosis и Str. pyogenes. Показана возможность использования полиморфизма гена sak0192 в качестве нового генетического маркера как для идентификации видовой принадлежности, так и для внутривидовой дифференцировки штаммов Str. agalactiae.