Молекулярная генетика, микробиология и вирусология №1 2010

Д. М. Ларкин
University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana IL 61801, USA, Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, 630090, Россия

Для корреспонденции:  Ларкин Денис Михайлович. E-mail: dlarkin@uiuc.ed

РОЛЬ ХРОМОСОМНЫХ ПЕРЕСТРОЕК И КОНСЕРВАТИВНЫХ УЧАСТКОВ ХРОМОСОМ В ЭВОЛЮЦИИ АМНИОТ

В обзоре предпринята попытка осмысления закономерностей эволюции хромосом млекопитающих и других амниот. Данные по сравнительному анализу хромосомной архитектуры указывают на неслучайное распределение районов хромосомных перестроек в геноме, вероятную роль хромосомных перестроек в адаптации, а также на то, что консервативные участки хромосом могут подвергаться отбору в ходе эволюции. Эволюционно стабильные районы хромосом насыщены генами, участвующими в раннем развитии организма, поэтому разрывы в этих районах могут быть несовместимы с выживанием организма. Дальнейший детальный анализ хромосомной эволюции требует вовлечения большего количества полностью секвенированных геномов.

Ключевые слова:  сравнительная геномика, эволюция геномов, амниоты

ЛИТЕРАТУРА

1. Ahituv N., Zhu Y., Visel A. et al. // PLoS Biol. — 2007. — Vol. 5, N 9. — P. e234.

2. Amaral M. E., Grant J. R., Riggs P. K. et al. // BMC Genom. 9. — 2008. — Vol. 9. — P. 631.

3. Avarello R., Pedicini A., Caiulo A. et al. // Hum. Genet. — 1992. — Vol. 89, N 2. — P. 247—249.

4. Ayala F. J., Coluzzi M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102. — Suppl. 1. — P. 6535—6542.

5. Bailey J. A., Baertsch R., Kent W. J. et al. // Genome Biol. — 2004. — Vol. 5, N 4. — P. R23.

6. Band M. R., Larson J. H., Rebeiz M. et al. // Genome Res. — 2000. — Vol. 10, N 9. — P. 1359—1368.

7. Bejerano G., Pheasant M., Makunin I. et al. // Science. — 2004. — Vol. 304, N 5675. — P. 1321—1325.

8. Bernstein B. E., Mikkelsen T. S., Xie X. et al. // Cell. — 2006. — Vol. 125, N 2. — P. 315—326.

9. Darai-Ramqvist E., Sandlund A., Muller S. et al. // Genome Res. — 2008. — Vol. 18, N 3. — P. 370—379.

10. Dermitzakis E. T., Reymond A., Scamuffa N. et al. // Science. — 2003. — Vol. 302, N 5647. — P. 1033—1035.

11. Dunham M. J., Badrane H., Ferea T. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2002. — Vol. 25. — P. 16144—16149.

12. Everts-van der Wind A., Kata S. R., Band M. R. et al. // Genome Res. — 2004. — Vol. 14, N 7. — P. 1424—1437.

13. Everts-van der Wind A., Larkin D. M., Green C. A. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, N 51. — P. 18526— 18531.

14. Haldane J. B. S., Sprunt A. D., Haldane N. M. // J. Genet. — 1915. — Vol. 5. — P. 133—135.

15. Hedges S. B., Kumar S. // Science. — 2002. — Vol. 297, N 5585. — P. 1283—1285.

16. Katzman S., Kern A. D., Bejerano G. et al. // Science. — 2007. — Vol. 317, N 5840. — P. 915.

17. Kehrer-Sawatzki H., Cooper D. N. // Chromosome Res. — 2008. — Vol. 16, N 1. — P. 41—56.

18. Larkin D. M., Everts-van der Wind A., Rebeiz M. et al. // Genome Res. — 2003. — Vol. 13, N 8. — P. 1966—1972.

19. Larkin D. M., Astakhova I. M., Kozhin A. et al. // Genetika. — 2004. — Vol. 40, N 7. — P. 961—967.

20. Larkin D. M., Astakhova N. M., Prokhorovich M. A. et al. // Cytogenet. Genome Res. — 2006. — Vol. 112, N 3—4. — P. 235— 240.

21. Larkin D. M., Prokhorovich M. A., Astakhova N. M., Zhdanova N. S. // Anim. Genet. — 2006. — Vol. 37, N 4. — P. 429—430.

22. Larkin D. M., Pape G., Donthu R. et al. // Genome Res. — 2009. — Vol. 19, N 5.

23. Lee T. I., Jenner P. G., Boyer L. A. et al. // Cell. — 2006. — Vol. 125, N 2. — P. 301—313.

24. Lindblad-Toh K., Wade C. M., Mikkelsen T. S. et al. // Nature. — 2005. — Vol. 438. — Vol. 438, N 7069. P. 803—819.

25. Ma J., Zhang L., Suh B. B. et al. // Genome Res. — 2006. — Vol. 16, N 12. — P. 1557—1565.

26. McKay S. D., Schnabel R. D., Murdoch B. M. et al. // Anim. Genet. — 2007. — Vol. 38, N 2. — P. 120—125.

27. Murphy W. J., Larkin D. M., Everts-van der Wind A. et al. // Science. — 2005. — Vol. 309, N 5734. — P. 613—617.

28. Nadeau J. H., Taylor B. A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1984. — Vol. 81, N 3. — P. 814—818.

29. Ohno S. // Nature. — 1973. — Vol. 244, N 5414. — P. 259— 262.

30. Pack S. D., Bedanov V. M., Sokolova O. V. et al. // Mamm. Genome. — 1992. — Vol. 3, N 2. — P. 112—118.

31. Pennacchio L. A., Ahituv N., Moses A. M. et al. // Nature. — 2006. — Vol. 444, N 7118. — P. 499—502.

32. Perez-Ortin J. E., Querol A., Puig S., Barrio E. // Genome Res. — 2002. — Vol. 12, N 10. — P. 1533—1539.

33. Pevzner P., Tesler G. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2003. — Vol. 100, N 13. — P. 7672—7677.

34. Rosier M. F., Reguigne-Arnould I., Couillin P. et al. // Genome Res. — 1995. — Vol. 5, N 1. — P. 60—70.

35. Schibler L., Roig A., Mahe M. F. et al. // BMC Genomics. — 2006. — Vol. 7. — P. 194.

36. Spitz F., Herkenne C., Morris M. A., Duboule D. // Nat. Genet. — 2005. — Vol. 37, N 8. — P. 889—893.

37. Springer M. S., Murphy W. J. // Biol. Rev. Camb. Philos. Soc. — 2007. — Vol. 82, N 3. — P. 375—392.

38. Tarchini B., Huynh T. H., Cox G. A., Duboule D. // Genes Dev. — 2005. — Vol. 19, N 23. — P. 2862—2876.

39. Threadgill D. S., Womack J. E. // Genomics. — 1991. — Vol. 11, N 4. — P. 1143—1148.

40. Waterston R. H., Lindblad-Toh K., Birney E. et al. // Nature. — 2002. — Vol. 420, N 6915. — P. 520—562.

41. Webber C., Ponting C. P. // Genome Res. — 2005. — Vol. 15, N 12. — P. 1787—1797.

42. Zhang N., Threadgill D. W., Womack J. E. // Genomics. — 1992. — Vol. 14, N 1. — P. 131—136.

43. Zhang N., Womack J. E. // Genomics. — 1992. — Vol. 14, N 1. — P. 126—130.