Молекулярная генетика, микробиология и вирусология №1 2010

Р. Р. Адгамов1, Н. Ф. Тимченко2, А. В. Алленов3, *С. А. Ермолаева1
1Учреждение РАМН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи РАМН, Москва; 2НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН, Владивосток; 3ФГУЗ Приморская противочумная станция, Уссурийск*

Для корреспонденции:  E-mail: sveta@ermolaeva.msk.ru

ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ФРАГМЕНТА ГЕНА INV, КОДИРУЮЩЕГО ФУНКЦИОНАЛЬНО-ЗНАЧИМЫЙ ДОМЕН ИНВАЗИНА YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS

Исследованы 84 изолята Y. pseudotuberculosis, выделенные на территории России в период с 1967 по 2008 г. Большинство (= 55) изолятов выделены из кала больных с диагнозом "псевдотуберкулез/дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка", подтвержденным клинически и серологически, в том числе 18 изолятов выделены в ходе расследования трех вспышек этого заболевания в Приморском крае; 9 изолятов получены из внутренних органов диких грызунов; остальные изоляты выделены из окружающей среды. 10 изолятов Y. pseudotuberculosis относились к серовару III, остальные — к серовару I. Для всех изолятов была определена последовательность 600 п. н. гена inv, кодирующих аминокислоты инвазина с 667-й по 866-ю. Всего выявлено 3 аллельных варианта. Аллель 1 преобладал, он обнаружен у 76 изолятов. В базе данных GenBank аллель 1 представлен штаммом IP31758, выделенным на Дальнем Востоке РФ. Аллель 2 отличался от аллеля 1 по трем позициям: G2299C, T2300C и T2302C. Мутации в положениях 2299 и 2302 были несинонимическими и приводили к заменам Ser768Thr и Val769Ala в последовательности белка. Аллель 2 был найден у 6 изолятов. Аллель 3 отличался от аллеля 2 одной синонимической заменой G2324T и был найден у двух штаммов. Этот аллельный вариант был найден в последовательности гена inv у изолятов Y. pestis, чьи последовательности представлены в базе данных GenBank. Не было обнаружено специфичности распределения аллелей в зависимости от серовара: Y. pseudotuberculosis серовара III и большинство изолятов серовара I несли аллель 1. Также не наблюдалось специфичности распределения аллелей в зависимости от региона выделения. При анализе распределения аллелей в субпопуляциях, сформированных в зависимости от источника выделения, показано, что субпопуляция иерсиний, выделенных от грызунов, достоверно отличалась от субпопуляции бактерий, выделенных от людей, и субпопуляции бактерий, выделенных из окружающей среды (< 0,05). Среди изолятов, полученных от больных людей, преобладал (95%) аллель 1, а среди изолятов, выделенных от грызунов, аллели 1 и 2 встречались примерно одинаково (55 и 45% соответственно).

Ключевые слова:  Yersinia, инвазин, полиморфизм

ЛИТЕРАТУРА

1. Грунин И. И., Сомов Г. П., Залмовер И. Ю. // Воен.-мед. журн. — 1960. — № 8. — С. 62—66.

2. Зайцева Е. А., Пуховская Н. М., Мусатов Ю. С. и др. // Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. — 2007. — Т. 9, № 1. — С. 80—88.

3. Знаменский В. А., Вишняков А. К. // Журн. микробиол. — 1967. — № 2. — С. 125—130.

4. Кузнецов В. Г. // Журн. микробиол. — 1997. — № 5. — С. 17—21.

5. Рожкова Л. П. Эпидемиология дальневосточной скарлатиноподобной лихорадки (псевдотуберкулеза человека) на Дальнем Востоке: Автореф. дис. ... канд. мед. наук. — 1977.

6. Сомов Г. П. Дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка. — М., 1979.

7. Сомов Г. П., Литвин В. Ю. Сапрофитизм и паразитизм патогенных бактерий. Экологические аспекты. — Новосибирск, 1988.

8. Тимченко Н. Ф., Недащковская Е. П., Долматова Л. С., Сомова-Исачкова Л. М. Токсины Yersinia pseudotuberculosis. — Владивосток, 2004.

9. Чеснокова М. В., Климов В. Т., Иванова Л. К., Попов А. В. В кн.: Иерсинии и иерсиниозы / Под ред. Г. Я. Ценевой. — СПб., 2006. — С. 7—34.

10. Aurell H., Farge P., Meugnier H. et al. // Appl. Environ. Microbiol. — 2005. — Vol. 71, N 1. — P. 282—289.

11. Carniel E. // Int. Microbiol. — 1999. — Vol. 2. — P. 161—167.

12. Carnoy C., Mullet C., Muller-Alouf H. // Infect. and Immun. — 2000. — Vol. 68. — P. 2553—2559.

13. Chain P. S., Carniel E., Larimer F. W. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101, N 21. — P. 13826—13831.

14. Cornelis G. R., Boland A., Boyd A. P. et al. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. — 1998. — Vol. 62, N 4. — P. 1315—1352.

15. Eppinger M., Rosovitz M. J., Fricke W. F. et al. // PloS Genet. — 2007. — Vol. 3, N 8. — P. 142.

16. Excoffier, Laval L. G., Schneider S. // Evol. Bioinform. Online. — 2005. — Vol. 1. — P. 47—50.

17. Isberg R. R., Voorhis D., Falkow S. // Cell. — 1987. — Vol. 50. — P. 769—778.

18. Jolley K. A., Feil E. J., Chan M. S., Maiden M. C. // Bioinformatics. — 2001. —Vol. 17, N 12. — P. 1230—1231.

19. Kumar S., Tamura T., Nei M. // Briefings in Bioinformatics. — 2004. — Vol. 5. — P. 150—163.

20. Nhieu Guy Tran Van, Isberg R. R. // EMBO J. — 1993. — Vol. 12, N 5. — P. 1887—1895.

21. Tanaka T., Nei M. // Mol. Biol. Evol. — 1989. — Vol. 6. — P. 447—459.

22. Thompson J. D., Higgins D. G., Gibson T. J. // Nucl. Acids Res. — 1994. — Vol. 22. — P. 4673—4680.

23. Weissman S. J., Chattopadhyay S., Aprikian P. et al. // Mol. Microbiol. — 2006. — Vol. 59, N 3. — P. 975—988.