Молекулярная генетика, микробиология и вирусология №1 2010

Т. Ю. Бондаренко1, В. А. Терновой1, В. А. Святченко1, Н. Н. Киселев1, Е. В. Чаусов1, М. А. Мунтянова2, Ю. В. Немцов2, В. В. Яшин2, Н. И. Крюк2, А. Г. Куслий2, Л. Г. Никулин2, С. В. Нетесов3
1ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора, пос. Кольцово Новосибирской области, 2ЗАО "Вектор-БиАльгам", пос. Кольцово Новосибирской области, 3Новосибирский государственный университет

Для корреспонденции:  Бондаренко Татьяна Юрьевна. E-mail: lemtat@ngs.ru

ПОЛНАЯ ГЕНОМНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ БЫСТРО РЕПЛИЦИРУЮЩЕГОСЯ ШТАММА ВИРУСА ГЕПАТИТА A МБ-7 И ЕЕ ХАРАКТЕРИСТИКА В СРАВНЕНИИ С НУКЛЕОТИДНЫМИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯМИ ДРУГИХ ШТАММОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА A

Определена полная нуклеотидная последовательность геномной РНК быстро реплицирующегося штамма вируса гепатита A (ВГA) МБ-7. Сравнение нуклеотидных и выведенных аминокислотных последовательностей показало практически полную (более 99%) идентичность штамма МБ-7 штамму HAS-15 и высокую гомологию с другими штаммами ВГA (HM-175/7, CR-326 и GBM/HFS), используемыми при производстве вакцин для профилактики гепатита A. Показано, что штамм МБ-7 относится к генотипу IA. Результаты проведенного филогенетического анализа свидетельствуют о наличии эволюционной близости исследуемого штамма со штаммом HAS-15 и циркулирующими на территории России вариантами ВГA. Сравнительный анализ отличий геномов штаммов МБ-7 и HAS-15 с другими штаммами ВГA выявил среди замен, присущих штамму МБ-7, замены, характерные для ранее описанных быстро реплицирующихся штаммов ВГA (н. о. 149—162 в 5’-нетранслируемой области и замены в генах VP3 и 2C). Это позволяет предположить функциональную значимость изменений в данных районах генома для повышенного уровня репликации МБ-7 in vitro.

Ключевые слова:  

ЛИТЕРАТУРА

1. Майданюк А. Г., Тюнников Г. И., Конакова В. Е. и др. // Вопр. вирусол. — 1993. — Т. 38, № 3. — С. 101—105.

2. Миронова Л. Л., Курбатов А. В., Грачев В. П. и др. // Вопр. вирусол. — 1984. — Т. 29, № 4. — С. 503—506.

3. Овчинников И. А., Свердлов Е. Д., Царев С. А. и др. // Докл. АН СССР. — 1985. — Т. 285. — С. 1014—1018.

4. Терновой В. А., Чаусов Е. В., Бондаренко Т. Ю. и др. // Вопр. вирусол. — 2006. — Т. 51, № 1. — С. 23—27.

5. Beneduce F., Pisani G., Divizia M. et al. // Virus Res. — 1995. — Vol. 36, N 2—3. — P. 299—309.

6. Carneiro S. J., Equestre M., Pagnotti P. et al. // J. Gen. Virol. — 1995. — Vol. 76. — P. 1189—1196.

7. Cohen J. I., Rosenblum B., Ticehurst J. R. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1987. — Vol. 84. — P. 2497—2501.

8. Costa-Mattioli M., Ferré V., Casane D. et al. // Virology. — 2003. — Vol. 311. — P. 51—59.

9. Davidkin I., Zheleznova N., Jokinen S. et al. // J. Med. Virol. — 2007. — Vol. 79, N 6. — P. 657—662.

10. Echeverri A., Banerjee R., Dasgupta A. // Virus Res. — 1998. — Vol. 54, N 2. — P. 217—223.

11. Graff J., Normann A., Feinstone S. M., Flehmig B. // J. Virol. — 1994. — Vol. 68. — P. 548—554.

12. Kumar S., Dudley J., Nei M., Tamura K. // Briefings in Bioinformatics. — 2008. — Vol. 9. — P. 299—306.

13. Kusov Y. Y., Probst C., Jecht M. et al. // Arch. Virol. — 1998. — Vol. 143, N 5. — P. 931—944.

14. Liu G., Hu N., Hu Y. // Wld J. Gastroenterol. — 2003. — Vol. 9, N 3. — P. 499—504.

15. Mao J. S., Dong D. X., Zhang H. Y. et al. // J. Infect. Dis. — 1989. — Vol. 159. — P. 621—624.

16. Nainan O. V., Armstrong G. L., Han X. H. et al. // J. Infect. Dis. — 2005. — Vol. 191, N 6. — P. 957—963.

17. Pina S., Buti M., Jardi R. et al. // J. Gen. Virol. — 2001. — Vol. 82. — P. 2955—2963.

18. Provost P. J., Hilleman M. R. // Proc. Soc. Exp. Biol. Med. — 1979. — Vol. 160. — P. 213—221.

19. Provost P. J., Bishop R. P., Gerety R. J. et al. // J. Med. Virol. — 1986. — Vol. 20. — P. 165—176.

20. Robertson B., Brown V., Khanna B. // Virus Res. — 1989. — Vol. 13. — P. 207—212.

21. Robertson B. H., Jansen R. W., Khanna B. et al. // J. Gen. Virol. — 1992. — Vol. 73. — P. 1365—1377.

22. Schultz D. E., Honda M., Whetter L. E. et al. // J. Virol. — 1996. — Vol. 70. — P. 1041—1049.

23. Wallace R. E., Vasington P. J., Petricciani J. C. et al. // In vitro. — 1973. — Vol. 8, N 5. — P. 333—341.